Antimicrobiële resistentie onderzoek bij het CIb

Bij het RIVM werken ruim 2200 collega’s elke dag samen aan de mogelijke zorgen van morgen. Bacteriën, maar ook schimmels en parasieten, die bij mens en dier infecties kunnen veroorzaken, blijken steeds vaker resistent te zijn tegen voorgeschreven behandelingen. Verschillende onderzoeksgroepen binnen het centrum voor infectieziektebestrijding (CIb) hebben tot gezamenlijk doel om infecties met resistente micro-organismen te voorkomen, dan wel te bestrijden. Binnen het AMR thema vindt een breed scala aan activiteiten plaats; surveillance in mens, dier en milieu; het ondersteunen van regionale zorgnetwerken; het stimuleren van data-uitwisseling tussen zorginstellingen en meer. Ook wordt er verdiepend wetenschappelijk onderzoek gedaan om betere of nieuwe inzichten te krijgen, maar ook om bovenstaande activiteiten te verbeteren of te ondersteunen. Wij zoeken 4 AIO’s op zeer diverse AMR onderwerpen, die allen afdeling overstijgend aan dit thema zullen gaan werken. Je maakt deel uit van dit AMR-AIO team. Je zal hierdoor met vele invalshoeken op het thema in aanraking komen.

Je maakt deel uit van de onderzoeksgroep AMR bij de afdeling Bacteriële Surveillance en Respons (BSR). Deze groep heeft tot doel om carbapenemase-producerende Enterobacterales/Pseudomonas aeruginosa en Meticilline-resistente Staphylococcus aureus te monitoren op landelijk nivo. Binnen het gehele thema AMR werk je samen met circa 50 mensen van verschillende afdelingen en centra binnen het RIVM, waaronder Zoönosen en Omgevingsbiologie (Z&O) en Epidemiologie en surveillance van Infectieziekten en Zoönosen (EPI). Het is een ambitieus team, wat zich typeert door inhoudelijke vak expertise en zich verbonden voelt in haar gezamenlijke passie voor het doen van vooruitstrevend onderzoek.

Doel van de functie

Je wordt verantwoordelijk voor het opzetten, organiseren en functioneel analyseren van de verspreiding van resistentie-plasmiden tussen mens, dier en milieu binnen het AMR-onderzoek in het RIVM.

Werkzaamheden en taken

In deze functie sta je opgesteld om plasmiden data van resistente bacteriën, verkregen van mensen en dieren met asymptomatisch dragerschap of klinische infecties en uit het milieu, te karakteriseren en hun verspreiding te analyseren m.b.v. grote next-generation en third-generation sequencing datasets en geavanceerde modelleringsmethoden. Je onderzoekt wie, welk dier, waar en wanneer en met welke resistente bacteriën besmet is én toont trends van plasmidenverspreiding aan, zodat er in de toekomst bestrijding en preventie kan plaatsvinden. Je zal vooral gebruikmaken van “big” data.

• Je ontwikkelt en implementeert nieuwe analysemethoden op een high performance computing systeem en weet relevante partijen te overtuigen en betrekken bij je onderzoek;
• Je analyseert grote hoeveelheden plasmiden sequencing data, daarbij gebruikmakend van je eigen ontwikkelde methoden en beschikbare sequencing analysemethoden;
• Je doet zelfstandig onderzoek binnen een team en publiceert dit in artikelen in peer-reviewed wetenschappelijke tijdschriften;
• Je onderhoudt lokale, nationale en internationale samenwerkingsverbanden op het gebied van resistentie plasmiden en AMR en zet nieuwe samenwerkingsverbanden op;
• Met jouw input aan de inhoudelijke visie en de strategie van het AMR-onderzoek binnen het RIVM heb je wezenlijk invloed;
• Je coördineert het werk i.s.m. interne en externe onderzoekers en daarnaast begeleid je een aantal studenten.

Uniek aan deze baan

In deze functie bij het RIVM sta je aan de voet van complex en innovatief onderzoek. De uitkomsten van jouw werk, hebben direct impact op de zorg van morgen. Je krijgt de kans om een breed (inter)nationaal netwerk binnen Public Health op te bouwen, en daar profiteer je je verdere carrière van. Je wordt bij het RIVM omringd door collega’s met veel wetenschappelijke expertise en ervaring en bent onderdeel van de grote thema’s in de microbiologische wereld, waarmee je daadwerkelijk bijdraagt aan de publieke gezondheid.

Dit neem je mee:

• Je hebt een academische opleiding op het gebied van bioinformatica afgerond (binnen het AMR werkveld is een pré);
• Uit je CV blijkt je belangstelling voor next-generation en third-generation sequencing dataverwerking en analyse, modellering en/of “big” data;
• Je hebt aantoonbare ervaring met het programmeren in python, bash en/of R, en bent bekend met de best practices om reproduceerbare code te schrijven;

Dit is jouw kracht:

Je bent rolbewust en resultaatgericht. Je hebt een overstijgende blik en weet data en kennis te verbinden. Samenwerken, presenteren en schrijfvaardigheid is je primaire natuur en je bent communicatief sterk. Als je eerder studenten begeleid hebt, dan is die ervaring heel handig. Je begrijpt en kan je weg vinden in potentieel gevoelige, moeilijke en soms stressvolle situaties. En tot slot zijn we op zoek naar een collega met een goed gevoel voor humor

Dienstverband voor bepaalde tijd: 48 maanden.

• Salarisomschrijving: Het salaris (36-urige werkweek) wordt vastgesteld op grond van bijlage B van het Bezoldigingsbesluit Burgerlijke Rijksambtenaren 1984, en loopt in 4 stappen op van schaal 8, salarisnummer 0 (€ 2675,- bruto per maand) naar schaal 8, salarisnummer 8, (€ 3344,- bruto per maand) in het vierde jaar.
• Dienstverband: Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
• Contractduur: 48 maanden
• Minimaal aantal uren per week: 32
• Maximaal aantal uren per week: 36

Overige arbeidsvoorwaarden

Naast het salaris ontvang je een Individueel Keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,37% van je bruto jaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je arbeidsvoorwaarden zelf samenstellen. Je kunt er bijvoorbeeld voor kiezen om een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaal vriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je OV-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.