Wij zijn op zoek naar een enthousiaste junior bioinformaticus om het team van de Core Facility Metabolomics (CFM) te versterken. Als junior bioinformaticus metabolomics en lipidomics ben je medeverantwoordelijk voor het verwerken, analyseren en interpreteren van complexe metabolomics en lipidomics datasets. Je werkt binnen een multidisciplinair team die voor onderzoekers datasets verwerken in de CFM op het gebied van gezondheid en ziekte. Dit ga je doen:

• Processen van lipidomics/metabolomics datasets met behulp van bestaande bioinformatische pipelines van ruwe massaspectrometrie data tot rapporteerbare output voor de onderzoeker (R, Matlab, vendor software; Thermo: Xcalibur en Bruker: MetaboScape/Tasq). Dit beslaat het grootste deel van je werktijd.
• Mede-ontwikkelen en implementeren van geavanceerde bioinformatica tools en workflows voor gegevensanalyse waarbij het identificeren van biomarkers en het uitvoeren van statistische analyses om biologische inzichten te verkrijgen centraal staat.
• Meewerken aan het FAIR maken van de data in samenwerking met andere groepen in Nederland zodat deze geschikt is voor multiomics analyses
• Samenwerken met onderzoekers om onderzoeksprojecten te ondersteunen en data-analyse te faciliteren.
• Rapporteren van resultaten en deelnemen aan wetenschappelijke publicaties en presentaties.

• Een master- of doctoraatstitel in (bio)informatica, computer sciences, biologie of een gerelateerd veld.
• Ervaring in het werken met metabolomics en lipidomics gegevens is een pré.
• Bekendheid met bioinformatica tools en software voor gegevensanalyse.
• Programmeerervaring met talen zoals R, MATLAB, Python of andere relevante programmeertalen.
• Sterke analytische en probleemoplossende vaardigheden.
• Goede communicatieve vaardigheden en het vermogen om effectief samen te werken binnen een multidisciplinair team.

• Een jaarcontract met uitzicht op een vast contract.
• Inschaling in salarisschaal 9: € 3.514 tot € 4.817 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring). Daarnaast ontvang je onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. Bereken hier jouw netto salaris.
• Gratis en onbeperkt toegang tot onze online leeromgeving GoodHabitz.
• Pensioenopbouw bij het ABP, waarvan wij 70% van de premie betalen.
• Een (gedeeltelijke) vergoeding van je OV-reiskosten. Kom je liever op de fiets? Dan hebben we een goede fietsregeling.
• Een actieve personeelsvereniging én Jong Amsterdam UMC vereniging, die beide leuke (sportieve) activiteiten en evenementen organiseren.

Amsterdam UMC

De Core Facility Metabolomics is onderdeel van het Laboratorium Genetische Metabole Ziekten (~100 werknemers), afdeling Laboratoriumgeneeskunde. De CFM bestaat uit een team van ongeveer 10 personen en onderscheidt zich door het gebruik van geavanceerde massaspectrometrie-apparatuur, professionele bioinformatica-tools en uitgebreide expertise op het gebied van metabolisme. Er wordt intensief samengewerkt met “the Bioinformatics Laboratory” van de afdeling Epidemiologie & Data Science (EDS) waar veel expertise is op het gebied van (bio)informatica, biostatistiek en computationele modellering, FAIR data en gebruik van openbare databases. Je zal op beide afdelingen werken.

Zie ook onze website: www.cfmetabolomics.nl