Promovendus ‘Innovatieve detectie van opkomende zoönosen'

Promovendus ‘Innovatieve detectie van opkomende zoönosen'

Geplaatst Deadline Locatie
15 nov 28 nov Bilthoven

Je kunt niet meer op deze vacature solliciteren (deadline was 28 nov 2023).

Bekijk het actuele vacature aanbod of kies een item in de hoofdnavigatie hierboven.

Wil je graag promoveren op onderzoek naar opkomende zoönosen en heb jij een master Bioinformatica of Systeembiologie afgerond of vergelijkbaar? Ben je geïnteresseerd in de detectie en systeembiologie van pathogenen en word je enthousiast van diepgaande bioinformatica analyses en wiskundige modellen? Dan is deze promotieplek echt iets voor jou!

Functieomschrijving

De afdeling

Bij het RIVM werken ruim 2400 collega’s elke dag samen aan de zorg voor morgen. Het centrum Zoönosen en Omgevingsmicrobiologie, wat valt binnen het domein infectieziekten & vaccinologie, heeft tot doel om de gezondheid van Nederland op het gebied van infectieziekten te analyseren en bewaken. Op de afdeling Dier & Vector (D&V) werken 30 collega’s aan het signaleren en bestrijden van zoönosen (infectieziekten van dieren die besmettelijk zijn voor de mens). Binnen deze afdeling kom je primair te werken in het cluster Veehouderij & Parasitologie. In dit  team met veel vakinhoudelijke expertise ligt de focus op zoönotische risico’s in de veehouderij en zoönotische parasieten in de veehouderij, gezelschapsdieren en wilde dieren, waarin de verschillende taken in gezamenlijkheid opgepakt worden.

Doel van de functie

De detectie van pathogenen in dierlijke reservoirs, de omgeving en voedsel is van cruciaal belang in het voorkomen en diagnose van zoönosen, zoönotische uitbraken en pandemieën. Door pathogenen te detecteren voordat ze mensen of dieren infecteren, kunnen nieuwe infecties voorkomen worden. Met de ontwikkeling van nieuwe DNA sequencing methodes is het mogelijk om pathogenen in voedsel, dieren en de omgeving te detecteren en typeren. Zowel de bemonstering en sequencing methodes als de analyse van deze data moeten verder ontwikkeld en toegespitst worden om de vroegtijdige detectie te optimaliseren en om de bronnen van pathogene organismen te achterhalen.

Dit onderzoek richt zich op de volgende onderzoeksvragen:

  • Kunnen we pathogeendetectie en -typering methoden ontwikkelen voor complexe matrices en verschillende domeinen en is next generation sequencing hiervoor mogelijk toepasbaar?
  • In welke omgevingen bevinden zich de pathogenen die mogelijk een zoönose of nieuwe pandemie kunnen veroorzaken?
  • Welke informatie en welk type data analysetechnieken zijn er nodig om deze vragen optimaal te kunnen beantwoorden?

Werkzaamheden en taken

In dit project ben je als promovendus de spil voor data analyse in een team van experts op het gebied van monstername en verwerking van monsters voor sequencing. Je denkt mee over de invulling van het project en vervolgens ben je verantwoordelijk voor uitvoering, verwerking en presentatie van de resultaten. Buiten het RIVM zul je samenwerken met onderzoekers van de Vrije Universiteit Amsterdam en andere onderzoekers in het veld.

  • Uitwerken van studieopzet;
  • Analyseren van next generation sequencing data;
  • Coördinatie van werkzaamheden;
  • Data-analyse en interpretatie;
  • Delen van onderzoeksresultaten in wetenschappelijke publicaties en op congressen.

Specificaties

Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM)

Functie-eisen

Wie ben jij

Je bent een nieuwsgierige onderzoeker die goed kan samenwerken binnen een team en met experts uit verschillende velden (veehouderij, leefomgeving, voedselveiligheid), en staat open voor inzichten van deze experts. Je werkt graag met data, en je hebt interesse in het laboratoriumwerk waardoor de data tot stand komen.

  • Je hebt een Master afgerond in de bioinformatica, systeembiologie en je bent goed onderlegd in de biologie en biochemie. Of je hebt een biologische of biochemische Master afgerond met een significante bioinformatica component;
  • Onderzoek past bij jou en is wat jij de komende vier jaar wil gaan doen;
  • Je hebt aantoonbare affiniteit met de statistische aspecten van de data analyse;
  • Je hebt een goede ontwikkeling van de Engelse taal;
  • Je neemt actief deel aan het team en je brengt meerwaarde als bioinformaticus.

Uniek aan deze baan

In deze functie werk je mee aan de zoönosensignalering in Nederland. Je levert een belangrijke bijdrage aan onze missie voor een gezonde bevolking en een duurzame, veilige en gezonde leefomgeving. Deze promotieplek biedt uitdaging, verantwoordelijkheid en ruime mogelijkheden om jezelf verder te ontwikkelen.

Arbeidsvoorwaarden

Dienstverband voor bepaalde tijd: 48 maanden.

  • Salaris­omschrijving: Je salaris wordt gedurende het promotieonderzoek als volgt vastgesteld:
    • het eerste jaar € 2.902,24 bruto per maand (volgens schaal 8, salarisnummer 0);
    • het tweede jaar volgens schaal 8, salarisnummer 5;
    • het derde jaar volgens schaal 8, salarisnummer 7;
    • het vierde jaar volgens schaal 8, salarisnummer 8.
  • Dienst­verband: Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
  • Contract­duur: Tijdelijke vacature voor de duur van de opleiding van 48 maanden
  • Maximaal aantal uren per week: 36

Naast het salaris ontvang je een Individueel Keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,37% van je bruto jaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je arbeidsvoorwaarden zelf samenstellen. Je kunt er bijvoorbeeld voor kiezen om een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaal vriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je OV-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.

 

Specificaties

  • PhD; Onderzoek, ontwikkeling, innovatie
  • Natuurwetenschappen
  • max. 36 uur per week
  • Universitair
  • AT RIVM 20231115

Werkgever

Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu (RIVM)

Lees meer over deze werkgever

Locatie

Antonie van Leeuwenhoeklaan 9, 3721 MA, Bilthoven

Bekijk op Google Maps

Interessant voor jou