Junior onderzoeker / programmeur

Voor deze functie zul je werken aan een project binnen de vakgroep Multi-Modality Medical Imaging (M3I) group. Binnen deze vakgroep focussen we ons onder andere op het beter begrijpen bekkenbodem problemen bij vrouwen. Deze problemen raken ongeveer de helft van alle vrouwen op een zeker moment in hun leven. Maar kennis van waarom ze ontstaan en welke oplossingen er zijn is beperkt.

Binnen het project van deze vacature werken we daarom toe naar een klinische tool voor het meten van de spierspannning van de vrouwelijke bekkenbodemspieren in ultrasoundfilmpjes.

We verwachten dat het meten van de spierspanning bijdraagt aan een beter begrip van het vrouwelijke bekken en uiteindelijk zal leiden tot nieuwe inzichten en zorgoplossingen. Voor het meten van de spierspanning zijn in een eerder onderzoeksproject twee research software pakketten ontwikkeld. Het eerste pakket is geschreven in Python en doet de automatische segmentatie van de bekkenbodemspieren. Deze segmentaties worden in het tweede softwarepakket (geschreven in Matlab) gebruikt als start om de spier te volgen door het ultrasound filmpje en vervolgens daaruit de spierspanning te meten.

Om deze twee pakketten in te gaan zetten in de klinische praktijk moeten gebruiksvriendelijk gemaakt worden door:

1. Het maken van Grafical user interface
2. Het optimaliseren van de software door:

• De softwarepakketten aan elkaar te koppelen, door er één softwarepakket van te maken, bijvoorbeeld in Python.
• Optioneel: Optimaliseren van de spierspanning metingen door het gebruik van GPU.
• Het hertrainen van de segmentatie software zodat deze werkt op de ultrasound data van de machine die we in het ZGT gebruiken.

De software zal binnen het project direct getest gaan worden binnen een klinische studie in het ZGT ziekenhuis in Hengelo.

De Multi-Modality Medical Imaging (M3I) group is een onderzoeksgroep op de grens tussen medisch beeldvormend onderzoek en de klinische praktijk. Door de aanwezigheid van zowel technische als medische onderzoek specialisten kunnen technische innovaties snel hun weg vinden naar de klinische praktijk. Hierdoor zijn we in staat zowel hoogwaardige onderzoeksresultaten te leveren en een directe impact te hebben op de zorg.