Promovendus 'Circulerend tumor DNA'

Promovendus 'Circulerend tumor DNA'

Geplaatst Deadline Locatie
14 mei 28 mei Nijmegen

Functieomschrijving

De afdeling van Medische Oncologie streeft naar het personaliseren van behandelingen voor patiënten met kanker. We zijn op zoek naar een zeer gemotiveerde PhD kandidaat met interesse in het uitvoeren van translationeel, klinisch relevant onderzoek bij patiënten met kanker. Dit onderzoek zal worden uitgevoerd op bloedmonsters van patiënten met verschillende tumortypes die over een langere tijd verzameld zijn/worden.

Circulerend tumor DNA is een revolutionaire multifunctionele bloed biomarker met grote verwachtingen met betrekking tot het verbeteren van doelgerichte therapie en immunotherapie voor patiënten met kanker. Door de niet-invasieve manier van opeenvolgende afnames van bloed wordt door vroege detectie een recidief van de ziekte snel opgespoord of respons op behandeling gemonitord. Voor de beoordeling en implementatie van circulerend tumor DNA werken we nauw samen met de afdelingen Genetica en Pathologie.

Je werkt samen met de afdeling Genetica voor het introduceren van next-generation sequencing (NSG) testen (hybride capture-based panel and shallow whole-genome sequencing) om mutaties op een niet-invasieve manier te beoordelen, het kopiëren van number alterations en molecular signatures van de cell-free circulating tumor DNA (ctDNA). Dit wordt allemaal gedaan door monsters te verzamelen van patiënten met bijvoorbeeld gynaecologische, speekselklier, hoofdhals, melanoom, sarcoom en urogenitale tumoren.

Voor de analyses van NGS zal je nauw samenwerken met andere PhD studenten en postdoctorale wetenschappers binnen de Liquid Biopsy onderzoeksgroep, de afdeling Medische Oncologie en het bioinformatica team van de afdeling Genetica. In je promotieteam zitten begeleiders van de afdeling Medische Oncologie en van de afdeling Genetica.

Taken en verantwoordelijkheden:
  • Het coördineren van bloedafnames in samenwerking met het bioptenteam en toegewijde medische oncologen.

Gebruik maken van verschillende methodes voor het detecteren van ctDNA:
  1. ddPCR voor het detecteren van specifieke mutaties in BRAF, NRAS en HRAS in melanomen.
  2. Verschillende aangepaste ctDNA-ontworpen genen panels voor het tumor-geïnformeerde onderzoek van ctDNA van gynaecologische, speekselklier, hoofd hals, en urogenitale kanker.
  3. Het gebruik van oppervlakkig whole genome sequencing om copy numer alterations and mutaties in sarcomen en BRCA of homologe recombination deficient tumours te detecteren.

  • Het optimaliseren van bioinformatische analyse pipeline voor het beoordelen van mutaties, copy number alterations, mutational signatures en ctDNA tumour content from ddPCR, ctDNA panels en van oppervlakkig whole-genome sequencing data.
  • Het correleren van ctDNA resultaten met klinisch relevante parameters.
  • Het bieden van ondersteuning en het overzien van de logistiek en datamanagement van patiënten die onderdeel zijn van het ctDNA programma.

Specificaties

Radboudumc

Functie-eisen

Wij zijn op zoek naar en enthousiaste PhD student die graag een bijdrage wil leveren aan het realiseren van onze missie om een gepersonaliseerde therapie te bieden aan patiënten met kanke. Je hebt sterkte interesse in het uitvoeren van translationeel kankeronderzoek, waarbij je tijdsverdeling ongeveer 50% wet-lab en 50% data-analyse en bioinformatica is.

Je herkent jezelf in onderstaand profiel:
  • Interesse in moleculaire celbiologie, bioinformatica, tumor genetica, next-generation sequencing platforms.
  • Bekend met het programmeren in R en/of Python (of sterk gemotiveerd dit te leren).
  • Gemotiveerd, neemt nitiatief en heeft ambitie voor het uitvoeren van ingewikkelde data analyses en deze te publiceren in tijdschriften met een hoge impact factor.
  • Goede organisatie vaardigheden en het vermogen om zowel zelfstanding als interdisciplinair te werken.
  • Uitstekende communicatie vaardigheden heeft, bijdragend aan een fijne samenwerking binnen het team. Je bent empathisch en sociaal ingesteld.
  • Vaardig in het Nederlands en in het Engels.

Arbeidsvoorwaarden

Dienstverband voor bepaalde tijd: 4 jaar.

Bij het Radboudumc bouw je aan de toekomst. We gaan voor de beste zorg, onderwijs en onderzoek. Dat maken we waar omdat je je bij ons ontwikkelt, kansen pakt en ruimte voelt om op te staan. Als werkgever vinden we het belangrijk dat medewerkers binnen alle levensfasen vitaal en met plezier aan het werk zijn. Dit in een gezonde en veilige omgeving. Onze arbeidsvoorwaarden mogen er ook zijn. Zo kun je rekenen op:
  • Inschaling is afhankelijk van vooropleiding. Voor een basisarts is schaal 10 van toepassing: tussen de € 3.493 en € 5.504 (fulltime). Voor overige studierichtingen geldt inschaling in schaal 10A: bij aanvraag van het dienstverband start jij in schaal 10A, stap 0 (€ 3.017 op basis van een fulltime dienstverband). In maximaal 4 jaar tijd groei je door naar schaal 10A, stap 3 (€3.824 op basis van een fulltime dienstverband). Ook krijg je 8% vakantiegeld, 8,3% eindejaarsuitkering en indien van toepassing op de functie, 47% tot 72% onregelmatigheidstoelage.
  • Volop kansen om je te ontwikkelen. Zo kun je via onze online leeromgeving uiteenlopende cursussen volgen.
  • Veel aandacht voor je welzijn en vitaliteit. Denk bij voorbeeld aan:
    • 40% korting op een sportabonnement van het Radboud Sportcentrum.
    • healthy professionals-programma waarin je leert om goed met je energie om te gaan.
    • bedrijfsopvangteam en een persoonlijke coach als je een ingrijpende gebeurtenis meemaakt
    • financieel gunstig minder werken via een generatieregeling als je de AOW-leeftijd nadert.
    • Ondersteuning in een goede werk-privébalans in alle fasen van je leven. Denk aan advies en trainingen over ‘Millennialdilemma’s’ tot ‘Je loopbaan na je 57ste’). Activiteiten bij ons eigen centrum voor mindfulness én mantelzorgspreekuren voor als je vragen hebt over het combineren van je werk en zorgtaken thuis.
  • 168 vakantie-uren per jaar op basis van een 36-urige werkweek. Wil je meer vakantie? Je kunt extra vakantie-uren kopen met je eindejaarsuitkering.
  • 26 weken ouderschapsverlof, waarvan 9 weken betaald.
  • Pensioenopbouw bij het ABP Pensioenfonds. Het Radboudumc betaalt 70% van de pensioenpremie.
  • Korting op de aanvullende pakketten van twee collectieve zorgverzekeringen én op tien andere verzekeringen; van woonhuis- tot rechtsbijstandsverzekering.
  • Een tegemoetkoming in je reiskosten via ons keuzemodel arbeidsvoorwaarden en een thuiswerkvergoeding van € 2,35 per dag.

Werkgever

Radboudumc

De afdeling Medische Oncologie is gedreven om iedere patiënt met kanker in de regio aantoonbaar de beste zorg te geven, nu en in de toekomst. Onze visie is dat we over 3 tot 5 jaar onze focus leggen op patiënten met zeldzame kanker of moeilijk behandelbare kanker. Wij leveren multidisciplinaire expertise-zorg in brede samenwerking met ons oncologisch netwerk Onco-Oost. Wij zijn voorloper in onderzoek en dragen door onderzoek en innovatie bij aan de passende zorg van morgen. In deze context blijven wij ons ontwikkelen en leiden wij de professionals van de toekomst op.

Een belangrijk streven van de afdeling is het vertalen van fundamenteel onderzoek naar een klinische toepassing. Verankerd in onze academische patiëntenzorg zijn zowel klinisch (geneesmiddelen-)onderzoek in een vroeg stadium als onderzoek gerelateerd aan farmacologie, pathologie, genetica en radiologie. Er is een nauwe band met de afdeling Genetica, waarbij de wetenschappelijke samenwerking gericht is op het bereiken van een beter begrip van kankerbiologie en het individualiseren van kankerbehandelingen door het moleculaire karakteriseren van tumorweefsel en zogenaamde liquid biopsies.

Binnen de afdeling Medische Oncologie zijn momenteel 17 stafleden werkzaam en meerdere artsen in opleiding tot specialist. Er is een team met enthousiaste en betrokken fellows, PhD studenten, arts-onderzoekers, PA's, verpleegkundig specialisten, casemanagers, het studieteam en studenten welke bijdragen aan het onderzoeks-, onderwijs-, en opleidingsklimaat van de afdeling. Als afdeling werken we vanuit de volgende kernwaarden: persoonsgericht, integer en transparant, innovatief, inclusief en verbindend, maatschappelijk verantwoord en duurzaam, gedrevenheid. Deze kernwaarden verbinden ons als team in hoe we samen werken en in wat we doen.

Het Radboudumc
Welkom bij het Radboudumc, waar onze onderzoeksgroepen streven naar innovatieve oplossingen die impact hebben op de gezondheid en gezondheidszorg. We dagen de status quo uit om huidige en toekomstige gezondheidsuitdagingen te overwinnen. Ons doel is om de toekomst van de gezondheidszorg te vormen voor de komende generaties. Onze focus ligt op preventie, duurzaamheid en betekenisvolle zorg, die we bereiken door onze diepgaande kennis van ziektemechanismen, klinische wetenschap, volksgezondheidsonderzoek, medische technologie en gegevenswetenschap. Onze benadering is gericht op doorbraken die de gepersonaliseerde gezondheidszorg en de volksgezondheid daadwerkelijk kunnen verbeteren.

Bij het Radboudumc biedt een uitgebreid scala aan onderzoeksprogramma's het kompas voor onze onderzoeksinspanningen. Elk programma heeft een duidelijk doel, waarbij samenwerking binnen en buiten onze organisatie zeer wordt gewaardeerd. We integreren zorg, onderwijs en onderzoek in samenwerking met onze patiënten om ervoor te zorgen dat onze onderzoeksprogramma's een significante impact hebben op de gezondheid en gezondheidszorg. We nodigen je uit om deel te nemen aan onze missie om een gezonde toekomst voor iedereen te creëren.

Additionele informatie

Benieuwd of deze functie bij je past? Of hoe het is om bij het Radboudumc te werken? Bel of mail dan met prof. dr. Carla van Herpen, internist oncoloog/afdelingshoofd of dr. Niven Mehra, internist oncoloog via (024) 361 03 53. Voor solliciteren gebruik de knop ‘solliciteer’.

Specificaties

  • PhD; Onderzoek, ontwikkeling, innovatie
  • Gezondheid
  • max. 36 uur per week
  • €3017—€5504 per maand
  • Universitair
  • 193063-P1517258-1

Werkgever

Locatie

Geert Grooteplein-Zuid 10, 6525 GA, Nijmegen

Bekijk op Google Maps

Interessant voor jou

X

Solliciteer op deze vacature

Solliciteer op deze vacature

Dit sollicitatieproces wordt beheerd door de werkgever (Radboudumc). Heb je nog aanvullende vragen over jouw sollicitatie, neem dan contact op met de werkgever.

Bedankt voor je sollicitatie

Voor vragen over jouw sollicitatie kun je contact opnemen met de werkgever.

Tip: sla deze vacature op als favoriet in je AcademicTransfer account. Zo heb je meteen een overzicht en kun je de vacature makkelijk terugvinden. Nog geen account? Maak deze dan nu aan en profiteer van nog meer handige functionaliteiten!

Sollicitatieprocedure

Benieuwd of deze functie bij je past? Of hoe het is om bij het Radboudumc te werken? Bel of mail dan met prof. dr. Carla van Herpen, internist oncoloog/afdelingshoofd of dr. Niven Mehra, internist oncoloog via (024) 361 03 53. Voor solliciteren gebruik de knop ‘solliciteer’.

Sollicitatieprocedure

Sollicitatieprocedure

Benieuwd of deze functie bij je past? Of hoe het is om bij het Radboudumc te werken? Bel of mail dan met prof. dr. Carla van Herpen, internist oncoloog/afdelingshoofd of dr. Niven Mehra, internist oncoloog via (024) 361 03 53. Voor solliciteren gebruik de knop ‘solliciteer’.

Solliciteer uiterlijk op 28 mei 2024 23:59 (Europe/Amsterdam).