Postdoc onderzoeker in Natural Language Processing in Health Data Science

De positie is ingebed binnen de afdeling cardiologie en richt zich voornamelijk op de ontwikkeling, klinische evaluatie en implementatie van technieken voor natuurlijke taalverwerking, met een specifieke focus op het gebruik van large language models (LLMs) voor verschillende taken. Concreet zal je bijdragen aan verschillende lopende projecten, gericht op: 1) LLM-gebaseerde structurering van klinische notities voor geoptimaliseerde data-extractie, 2) evaluatie van LLM-gebaseerde richtlijn nalevingsbeoordeling, en 3) ontwikkeling en testen van verklaarbare AI-ondersteunde klinische beslissingsondersteuningssystemen. Deze projecten zijn ingebed in de EU Horizon DataTools4Heart, AI4HF en AIXPERT-projecten, die zich richten op de ontwikkeling van betrouwbare en verklaarbare AI-tools in de cardiologie. DataTools4Heart richt zich specifiek op de ontwikkeling van tools voor het hergebruik van elektronische gezondheidszorgdata voor onderzoeksdoeleinden. AI4HF richt zich op de ontwikkeling van betrouwbare AI-modellen voor klinische implementatie bij hartfalenpatiënten en AIXPERT richt zich op de ontwikkeling en evaluatie van betrouwbare LLM-gebaseerde systemen voor klinische beslissingsondersteuningssystemen.

Daarnaast zal je direct samenwerken met het start-upbedrijf HealthSage AI, dat een eigen Large Language Model heeft ontwikkeld voor de optimalisatie van klinische werkstromen. Gedurende het project zal het LLM-model worden geoptimaliseerd en geëvalueerd in de context van verschillende klinische werkstromen, waaronder zowel poliklinische als (acute) klinische zorginstellingen.

Wij zijn op zoek naar een postdoc kandidaat die enthousiast is om verantwoorde NLP-methoden te ontwerpen, implementeren en evalueren in de context van verschillende projecten. Je zult state-of-the-art LLM's voorstellen en Nederlandse en/of meertalige taalkundige middelen ontwikkelen met een sterke focus op zorgtoepassingen binnen de cardiologie. Je zult actief deelnemen aan de klinische evaluatie en implementatie van deze modellen en samenwerken met andere postdoctorale onderzoekers in Europa. Je krijgt de kans om statistische en machine learning-technieken toe te passen op een reeks klinisch relevante problemen in de cardiologie, die samen met medische specialisten gedefinieerd en besproken zullen worden.

Ook zal je deel uitmaken van een interdisciplinair team bestaande uit informatici, medische professionals, PhD-studenten en postdoctorale onderzoekers, en zal je ook de kans krijgen om samen te werken met informatici en software-engineers binnen Amsterdam UMC. De voorkeur gaat uit naar een achtergrond die technische kennis combineert met een sterke klinische achtergrond, zodat je in staat bent om klinische evaluatie- en implementatiestudies te ontwerpen en uit te voeren, ondersteund door technische onderzoekers. Je zult efficiënte en schaalbare implementaties van je methoden bieden en deze integreren met populaire open-source systemen.

Wij zijn op zoek naar een zeer gemotiveerde postdoc onderzoeker met een sterke technologische en klinische achtergrond, bij voorkeur met kennis van systemen voor natuurlijke taalverwerking.

Vereisten:

• PhD in machine learning, AI, medische informatica, statistiek, data science of verwante vakgebieden;
• Sterke klinische en technische achtergrond, bij voorkeur in technische geneeskunde of een vergelijkbaar vakgebied;
• Vermogen om technische en klinische kennis te combineren voor het ontwerpen en uitvoeren van klinische evaluatie- en implementatiestudies;
• Praktijkervaring in natuurlijke taalverwerking, machine learning, medische informatica en/of data science;
• Ervaring met klinische evaluatie- en implementatiestudies;
• Programmeervaardigheden in Python en ervaring met machine learning-systemen (bijv. scikit-learn, PyTorch);
• Goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal, zowel mondeling als schriftelijk.

Niet vereist, maar wel nuttig:

• Ervaring met voorspellende modellering, data-harmonisatie en ontologieën;
• Ervaring met klinische data en/of cardiologie;
• Bijdrage aan open-source projecten.

• Volledig gefinancierde postdoctoraal positie: wij bieden een aanstelling voor één jaar (12 maanden) met de intentie om deze met nog eens 24 maanden te verlengen, voor in totaal 3 jaar.
• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk;
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven;
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld;
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV;
• De mogelijkheid om zelf aan te geven hoeveel en welke dagen je wil werken (minimaal 5 uur per week, bij voorkeur 5u - 10u per week, meer is ook mogelijk)
• Je kunt op een laptop werken en bent niet locatie gebonden.
• Inschaling in salarisschaal 10: € 3.493 tot € 5.504 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris;
• Vakantie-uren: 190,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen;
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen;
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis;
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV

Je wordt aangesteld in zowel de afdeling Medische Informatica als het Amsterdam Center for Computation Cardiology van Amsterdam UMC. Je zult nauw samenwerken met leden van beide afdelingen. Je werkt in een team samen met dr. Stephan van der Zwaard, dr. Noman Dormosh, dr. Marcel Alberti, dr. Machteld Boonstra en prof. Folkert Asselbergs.

Dr. Van der Zwaard is de klinisch data-architect en richt zich op het hergebruik van EPD-gegevens voor onderzoeksdoeleinden en het implementeren van dergelijke pipelines binnen Amsterdam UMC. Dr. Dormosh is een postdoctoraal onderzoeker die zich richt op de klinische toepassing van LLM's. Dr. Alberti is de medeoprichter van HealthSage AI en leidt het wetenschappelijke team binnen HealthSage AI dat zich richt op de implementatie, optimalisatie en evaluatie van het HealthSage AI Large Language Model. Dr. Boonstra is een postdoctoraal onderzoeker met een achtergrond in technische geneeskunde, expertise in elektrocardiografische beeldvorming en interesse in multi-modale AI. Prof. Asselbergs is cardioloog en geïnteresseerd in precisiegeneeskunde met behulp van gekoppelde databronnen, zoals draagbare informatie en routinematige zorggegevens verkregen uit elektronische patiëntendossiers, inclusief vrije tekst.

Binnen verschillende consortia zal je samenwerken met diverse klinische centra uit heel Europa, zoals de Universiteit van Barcelona (Spanje), Barcelona Supercomputing Centre (Spanje), Athena Research Centre (Griekenland) en verschillende MKB's: HealthSage AI (Nederland), Lynkeus Srl (Italië), Software Research & Development Corporation (Turkije), Kyklos (GB) en Translated Srl (Italië).

Er is ruimte voor de individuele onderzoeker om internationale ervaring op te doen. Naast het verwerven van medische en gezondheidsinformatica-expertise, vinden we persoonlijke ontwikkeling belangrijk, ook buiten de traditionele kaders van wetenschappelijk onderzoek. Diversiteit, ruimte voor persoonlijke inbreng, autonomie en energieke werkprocessen zijn sleutelwoorden die de groep kenmerken.

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

Bekijk de video voor meer informatie.