Data scientist of computer science engineer voor ANEURYSM-NL consortium

Onderzoek naar aneurysmaziekten kent uitdagingen vanwege versnipperde data. Dit project heeft als doel een duurzame data-infrastructuur te creëren door klinische, beeldvormende, genetische en registratie databases samen te voegen. Met een gefedereerde aanpak wordt veilige gegevensuitwisseling mogelijk gemaakt, evenals samenwerking tussen verschillende disciplines. Daarnaast ondersteunt het platform toepassingen van kunstmatige intelligentie en machine learning, gericht op gepersonaliseerde behandeling en prognose. De infrastructuur zal voldoen aan de FAIR-principes en aan zowel nationale als Europese regelgeving.

De titel van het project is: Gepersonaliseerde behandeling voor aneurysma's (PRIMA) voor het ANEURYSM-NL consortium.

In deze rol ontwerp en implementeer je een privacybeschermend, gefedereerd dataplatform dat diverse datasets van ziekenhuizen, biobanken en onderzoekscentra integreert. Je werk stelt onderzoekers in staat om gedecentraliseerde data te benaderen en te analyseren, binnen de FAIR-principes (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) en in overeenstemming met EU-regelgeving zoals WEGIZ, EHDS en de AI Act.

Deze functie bevindt zich op het snijvlak van gezondheidszorg, datawetenschap en technologie en biedt een unieke kans om bij te dragen aan een baanbrekend project dat de manier waarop medische data wordt gedeeld, geanalyseerd en gebruikt in meerdere disciplines transformeert.

Je werkt nauw samen met clinici, onderzoekers en data engineers om een duurzame infrastructuur te bouwen die geavanceerde machine learning en kunstmatige intelligentie (AI)-toepassingen ondersteunt. Dit omvat het ontwikkelen van ETL-pipelines, het opzetten van een federatief querysysteem en het implementeren van privacybeschermende mechanismen voor het koppelen van records. Jouw bijdragen zullen direct bijdragen aan de mogelijkheid om levenslooptrajecten van patiënten te reconstrueren, gepersonaliseerde uitkomstvoorspellingen te verbeteren en onderzoek naar aneurysma's te bevorderen.

Je bent een getalenteerde en gemotiveerde data scientist of computer science engineer om ons innovatieve team te versterken en te werken aan de ontwikkeling van een gefedereerde data-infrastructuur voor onderzoek naar aneurysma's. Je neemt mee:

• Masterdiploma in medische informatica, computerwetenschappen, software-engineering, bio-informatica of een gerelateerd vakgebied.
• Kennis van programmeertalen zoals Python, Java en R.
• Ervaring met ETL-tools en data-integratieframeworks.
• Kennis van Common Data Models (CDM's) zoals OMOP CDM en HL7 FHIR.
• Kennis van gefedereerde databases en privacybeschermende technologieën (bijv. SHA256-hashing, differentiële privacy).
• Ervaring met metadatabeheer, cloud computing en gedistribueerde systemen is een pluspunt. Kennis van medische datastandaarden (bijv. DICOM, MIABIS) is ook een pluspunt.
• Kennis van Nederlands is een pré.

• Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
• Alle ruimte voor jouw drive om de zorg van morgen vorm te geven.
• Werken aan grootschalig én eigen onderzoek, met gemotiveerde collega’s uit alle hoeken van de wereld.
• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden, met de intentie te verlengen tot een totaal van 3 jaar.
• Inschaling in salarisschaal 10: € 3.598 tot € 5.669 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring) en een eindejaarsuitkering van 8,3%. Bereken hier jouw netto salaris.
• Vakantie-uren: 190,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en een mogelijkheid om uren bij te sparen.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
• Bij 7 km of meer (enkele reis) 100% OV-vergoeding en bij eigen vervoer €0,18 per km tot maximaal 40 km enkele reis.
• Kom je liever lopend of op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling. Je ontvangt een vergoeding à €0,18 per km.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Amsterdam UMC Research BV ondersteunt non-profit wetenschappelijk onderzoek. Met onze faciliteiten bieden we onderzoekers alles wat ze nodig hebben om te excelleren. Zo bieden we onze Principal Investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectmanagement, financiën en personeelszaken. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten bieden we ook juridische ondersteuning. Bekijk de video voor meer informatie.

Je wordt begeleid door prof. dr. Kak Khee Yeung, projectleider en hoofd van de onderzoeksgroep translationele vaatchirurgie. Je werkt nauw samen met dr. Kevin Veen, universitair docent aan het Erasmus MC en mede-projectleider. Daarnaast werk je samen met dr. Venkat Ayyalasomayajula (postdoc) en prof. Ronald Cornet, die expertise in data science en medische informatica inbrengen in het team. Samen zal dit multidisciplinaire team je begeleiden en ondersteunen bij het behalen van de projectdoelen.

In dit onderzoek wordt nauw samengewerkt met partners uit verschillende disciplines en partnerinstituten binnen het consortium en met onderzoekers die betrokken zijn bij het EU-initiatief VASCUL-AID om de doelstellingen van het project te verwezenlijken.