Antimicrobiële resistentie onderzoek bij het CIb

Bij het RIVM werken ruim 2200 collega’s elke dag samen aan de mogelijke zorgen van morgen. Bacteriën, maar ook schimmels en parasieten, die bij mens en dier infecties kunnen veroorzaken, blijken steeds vaker resistent te zijn tegen voorgeschreven behandelingen. Verschillende onderzoeksgroepen binnen het centrum voor infectieziektebestrijding (CIb) hebben tot gezamenlijk doel om infecties met resistente micro-organismen te voorkomen, dan wel te bestrijden. Binnen het AMR thema vindt een breed scala aan activiteiten plaats; surveillance in mens, dier en milieu; het ondersteunen van regionale zorgnetwerken; het stimuleren van data-uitwisseling tussen zorginstellingen en meer. Ook wordt er verdiepend wetenschappelijk onderzoek gedaan om betere of nieuwe inzichten te krijgen, maar ook om bovenstaande activiteiten te verbeteren of te ondersteunen. Wij zoeken 4 AIO’s op zeer diverse AMR onderwerpen, die allen afdeling overstijgend aan dit thema zullen gaan werken. Je maakt deel uit van dit AMR-AIO team. Je zal hierdoor met vele invalshoeken op het thema in aanraking komen.

Je maakt deel uit van de onderzoeksgroep AMR bij de afdeling Bacteriële Surveillance en Respons (BSR). Deze groep heeft tot doel om carbapenemase-producerende Enterobacterales/Pseudomonas aeruginosa en Meticilline-resistente Staphylococcus aureus te monitoren op landelijk nivo. Binnen het gehele thema AMR werk je samen met circa 50 mensen van verschillende afdelingen en centra binnen het RIVM, waaronder Zoönosen en Omgevingsbiologie (Z&O) en Epidemiologie en surveillance van Infectieziekten en Zoönosen (EPI). Het is een ambitieus team, wat zich typeert door inhoudelijke vak expertise en zich verbonden voelt in haar gezamenlijke passie voor het doen van vooruitstrevend onderzoek.

Doel van de functie

Je wordt verantwoordelijk voor het opzetten, organiseren en functioneel analyseren van de verspreiding van resistentie-plasmiden tussen mens, dier en milieu binnen het AMR-onderzoek in het RIVM.

Werkzaamheden en taken

In deze functie sta je opgesteld om plasmiden data van resistente bacteriën, verkregen van mensen en dieren met asymptomatisch dragerschap of klinische infecties en uit het milieu, te karakteriseren en hun verspreiding te analyseren m.b.v. grote next-generation en third-generation sequencing datasets en geavanceerde modelleringsmethoden. Je onderzoekt wie, welk dier, waar en wanneer en met welke resistente bacteriën besmet is én toont trends van plasmidenverspreiding aan, zodat er in de toekomst bestrijding en preventie kan plaatsvinden. Je zal vooral gebruikmaken van “big” data.

• Je ontwikkelt en implementeert nieuwe analysemethoden op een high performance computing systeem en weet relevante partijen te overtuigen en betrekken bij je onderzoek;
• Je analyseert grote hoeveelheden plasmiden sequencing data, daarbij gebruikmakend van je eigen ontwikkelde methoden en beschikbare sequencing analysemethoden;
• Je doet zelfstandig onderzoek binnen een team en publiceert dit in artikelen in peer-reviewed wetenschappelijke tijdschriften;
• Je onderhoudt lokale, nationale en internationale samenwerkingsverbanden op het gebied van resistentie plasmiden en AMR en zet nieuwe samenwerkingsverbanden op;
• Met jouw input aan de inhoudelijke visie en de strategie van het AMR-onderzoek binnen het RIVM heb je wezenlijk invloed;
• Je coördineert het werk i.s.m. interne en externe onderzoekers en daarnaast begeleid je een aantal studenten.

Uniek aan deze baan

In deze functie bij het RIVM sta je aan de voet van complex en innovatief onderzoek. De uitkomsten van jouw werk, hebben direct impact op de zorg van morgen. Je krijgt de kans om een breed (inter)nationaal netwerk binnen Public Health op te bouwen, en daar profiteer je je verdere carrière van. Je wordt bij het RIVM omringd door collega’s met veel wetenschappelijke expertise en ervaring en bent onderdeel van de grote thema’s in de microbiologische wereld, waarmee je daadwerkelijk bijdraagt aan de publieke gezondheid.