De afdeling Medische Microbiologie is zeer actief op het terrein van diagnostic en antimicrobial stewardship. Hoe zorgen we ervoor dat de patiënt de juiste diagnostiek krijgt en de beste therapie?

Dagelijks wordt door velen in het ziekenhuis data vastgelegd die ons kunnen steunen onze diagnostische processen te verbeteren en de therapie van de individuele patiënt. Wij zoeken een enthousiaste data scientist/modelleur/epidemioloog met interesse in infectieziekten, wetenschappelijk onderzoek en zorgprocessen. Je neemt de regie om kennis te ontsluiten uit Elektronisch Patiënten Dossier (EPD, Radboudumc gebruikt EPIC) en ons laboratorium informatie systeem (GLIMS versie 9) die kunnen helpen de processen op de afdeling Medische Microbiologie te optimaliseren. Hiervoor werk je nauw samen met arts-microbiologen, deskundigen infectiepreventie, laboratorium analisten en aanvragende specialismen en regionale partners. In samenwerking met het Canisius Wilhelmina ziekenhuis (CWZ) onderzoek je hoe antibioticaresistentie surveillance gegevens ons antibioticumbeleid kunnen informeren. Je draagt actief bij aan innovaties van zorg, zowel inhoudelijk als op het gebied van organisatie.

Taken en verantwoordelijkheden

• Zoeken naar kansen en mogelijkheden in een aanzienlijke hoeveelheid data;
• Opschonen en verwerken van ruwe data tot bruikbare data en deze beheren;
• Identificeren van vragen vanuit de afdeling Medische Microbiologie of samenwerkende afdelingen uit het ziekenhuis;
• Herkennen van patronen in 'big data', om hiervoor een voorspellend algoritme (zelflerend wiskundig model) te ontwikkelen - ('machine learning' ), bijvoorbeeld voor het herkennen van patiënten met een mogelijke infectie waarbij diagnostiek afgenomen zouden moeten worden;
• Inzetten van voorspellende algoritmes ten behoeve van besluitvorming;
• Beschrijven en visualiseren van ontdekte inzichten en voorspellingen en deze rapporteren/ delen met belanghebbenden;
• Beheren en optimaliseren van datastromen en data-analyses;
• Opstellen, aansturen en/of trainen van een data science team binnen de afdeling Medische Microbiologie;
• Begeleiden van onderzoek;
• Initiëren/assisteren van subsidieaanvragen voor onderzoek op toegepaste big data science in het werkveld infectieziekten / medische microbiologie;
• Samenwerking initiëren met regionale partners.

Je hebt een achtergrond in een exacte (biomedische) wetenschap, bijvoorbeeld op basis van een van de volgende opleidingen:

• Biomedische wetenschappen, epidemiologie (wo);
• Informatica (hbo, wo);
• Econometrie (wo);
• Wiskunde (hbo, wo);
• Natuurkunde (hbo, wo).

Daarnaast heb je aantoonbare ervaring met het opzetten, uitvoeren en afronden van wetenschappelijk onderzoek in het werkveld big data, data science en/of medische wetenschap, bijvoorbeeld met een afgerond Master of promotieonderzoek (PhD).

Je beschikt over een gedegen kennis van IT, inclusief de nodige programmeervaardigheden. Je weet de juiste tools en software te gebruiken om algoritmes te schrijven om bruikbare data uit de ziekenhuisregistratiesystemen te ontsluiten, te structureren en te analyseren. Tevens ben je in staat om een brug te slaan tussen deze databronnen en de klinische praktijk en blijf je gericht op de uiteindelijke toepassing van deze activiteiten. Ook zijn kennis en vaardigheden vereist op het gebied van onder meer:

• Data science tools als R, SQL , SAS, MatLab;
• Eén of meer programmeertalen (veelal Python);
• Grote databases en/of datamodellen (Hadoop, Spark, SQL);
• Simulaties, scenario-analyses en algoritmes (modellen);
• Ervaring met EPIC of GLIMS is wenselijk.

Je bent in staat grote hoeveelheden data te verwerken uit verschillende (al dan niet gestructureerde) bronnen (oftewel 'big data') om deze om te zetten naar bruikbare informatie voor het managen van infectieziekten, infectiepreventie en antibioticabeleid in het ziekenhuis. Deze data gebruik je om te extrapoleren en modellen te bouwen met als doel de zorgprocessen te verbeteren.

Je beschikt over de nodige sociale vaardigheden om kennis en kunde over data-extractie en -analyse over te dragen aan collega's van de afdeling en je functioneert goed in een multidisciplinaire omgeving. Kennis van en affiniteit met infectieziekten en antibioticaresistentie is een pre.

Tot slot herken je jezelf in de Radboud manier van werken.

Afhankelijk van kennis en ervaring vindt inschaling plaats in schaal 8 (maximaal € 3.391) of schaal 9 (maximaal € 3.837) van de Cao umc, bruto per maand op basis van een volledig dienstverband.

Bij indiensttreding vragen wij om een verklaring omtrent gedrag (VOG) en vindt er een screening plaats op basis van het aangeleverde cv. De procedure hiervoor verloopt via de afdeling HR van het Radboudumc.

Lees meer over de arbeidsvoorwaarden en sollicitatieprocedure binnen het Radboudumc.

Radboudumc

Medische Microbiologie
De afdeling Medische Microbiologie van het Radboudumc verzorgt het gehele pakket aan diagnostiek in alle deelgebieden van de medische microbiologie. Er werken circa 110 medewerkers voor patiëntenzorg (inclusief Hygiëne en Infectiepreventie), onderzoek, onderwijs en opleiding. Momenteel zijn er 11 artsen-microbioloog met verschillende aandachtsgebieden en twee medisch moleculair microbiologen verbonden aan de afdeling. Naast de diagnostiek en consultatieve dienstverlening voor het Radboudumc verzorgt de afdeling tevens de diagnostiek en consultatie voor Dekkerswald (longziekten) en het Maasziekenhuis te Boxmeer.

De afdeling Medische Microbiologie is nationaal en internationaal zeer actief op diverse onderzoeksgebieden. Tevens maakt het laboratorium deel uit van aantal NFU expertise centra waaronder die voor mycologie en tuberculose. Verder is de afdeling actief op het gebied van sequentie analyse van micro-organismen, sneldiagnostiek, en vernieuwing van zorgprocessen (bijvoorbeeld antimicrobial stewardship en infectiepreventie). De afdeling participeert in facultair onderwijs aan studenten geneeskunde, biomedische wetenschappen en tandheelkunde. Er is een opleiding tot arts-microbioloog en tot medisch moleculair microbioloog.

Het Radboudumc
Het Radboudumc wil voorop lopen in de ontwikkeling van duurzame, innovatieve en betaalbare gezondheidszorg (persoonsgericht en innovatief). En daarmee aan de gezondheid van mens en maatschappij in Nederland en daarbuiten. Onze missie is dan ook: To have a significant impact on healthcare. Bekijk zelf hoe dat zich uit in onze strategiefilm.

Lees meer over wat werken bij het Radboudumc betekent en hoe jij daaraan kan bijdragen.