PhD student to study mechanisms of DNA damage induced-transcription stress

Transcriptieremming door geleidelijke ophoping van DNA-schade is een belangrijke oorzaak van neurodegeneratie en veroudering. DNA-schade zorgt voor een directe fysieke blokkade van RNA-polymerase II, wat leidt tot initiatie van transcriptie-gekoppelde DNA-reparatie om de DNA-schade te verwijderen. DNA-schade veroorzaakt ook indirect een genoomwijde transcriptieremming, die vooral belangrijk is wanneer DNA-schade langdurig aanwezig is, zoals tijdens kankertherapie en veroudering. Ons laboratorium is gespecialiseerd in transcriptie-gekoppelde en andere aan nucleotide-excisieherstel gerelateerde DNA-reparatiemechanismen (https://lanslab.eu/publications/). Dit project is gebaseerd op onze eerdere bevindingen dat persisterende DNA-reparatie-intermediairen de transcriptie verstoren en schadelijker zijn dan DNA-schade zelf, zoals onder andere beschreven in Muniesa-Vargas et al., Nature Communications, 2024; van der Woude, bioRxiv, 2025; en van Sluis et al., Nature Reviews MCB, 2025.

De precieze eiwitten en mechanismen die de integriteit van transcriptie bij persisterende DNA-schade reguleren, zijn nog niet goed bekend. In dit project zullen we forward genetische screens uitvoeren in het modelorganisme C. elegans om nieuwe mediatoren van deze transcriptiestressrespons te identificeren. Deze nieuwe mediatoren zullen vervolgens functioneel worden gekarakteriseerd met behulp van genetische en celbiologische analyses, in combinatie met geavanceerde DNA-reparatie, live-cell imaging en proteomics technieken, zowel in C. elegans als in humane cellen. We verwachten dat dit onderzoek nieuw inzicht zal bieden in hoe door DNA-schade geïnduceerde transcriptiestress bijdraagt aan veroudering, neurodegeneratie en toxiciteit veroorzaakt door chemotherapie.

We zoeken een gemotiveerde kandidaat met een MSc-diploma van een relevante opleiding (bijv. Moleculaire/Celbiologie, Biomedische/Moleculaire Wetenschappen, Life Sciences, Nanobiologie). Ervaring met DNA-reparatieonderzoek en/of met C. elegans is een pré, maar is niet vereist. De kandidaat moet in staat zijn om zelfstandig onderzoeksprojecten te bedenken, uit te voeren en te analyseren en beschikken over uitmuntende theoretische en experimentele onderzoeksvaardigheden. De kandidaat is verder goed georganiseerd, resultaatgericht en een sterke teamspeler.

Een goede beheersing van (wetenschappelijk) Engels in woord en geschrift is essentieel (EUR-vereisten: minimale IELTS-score van 7.0 [vergelijkbaar met TOEFL PBT: 600; TOEFL CBT: 250; TOEFL iBT: 95]). Sollicitaties dienen in het Engels te worden ingediend. De kandidaat moet verder een Verklaring Omtrent het Gedrag (VOG) en een geldig identiteitsbewijs kunnen overleggen.

De afdeling Moleculaire Genetica van het Erasmus MC (https://www.erasmusmc.nl/en/research/departments/molecular-genetics) heeft een sterke wereldwijde reputatie op het gebied van de DNA-schaderespons, op moleculair, cellulair en fysiologisch niveau. De afdeling bestaat uit een energieke en internationale groep van meer dan 80 onderzoekers die ieder werken aan verschillende aspecten van DNA-schade, DNA-reparatie en andere aan DNA-schade gerelateerde mechanismen. Dit project zal worden uitgevoerd in het Lans DNA repair lab (www.lanslab.eu). Het Lans DNA repair lab bestudeert de moleculaire mechanismen van DNA-reparatie in relatie tot ziekte, met behulp van genetica en moleculaire celbiologie, gecombineerd met live-cell imaging en proteomics, in C. elegans en humane cellen als modelsystemen. Onze groep werkt intensief samen met andere onderzoeksgroepen binnen de afdeling en gezamenlijk hebben wij een sterke internationale reputatie op het gebied van DNA-reparatieonderzoek. Wij bieden een uitdagende onderzoeksomgeving met veel samenwerking en een goede opleiding via het PhD-onderwijsprogramma van onze Erasmus MC Graduate School (https://www.erasmusmc.nl/nl-nl/graduate-school).

Het Erasmus MC staat voor een gezonde bevolking en excellentie in de gezondheidszorg. Door baanbrekend werk te verrichten, streven wij ernaar grenzen te verleggen door voorop te lopen in onderzoek, onderwijs en zorg, om zo de gezondheidszorg van vandaag en de publieke gezondheid van morgen te verbeteren en te vernieuwen. Ter stimulering van onderzoek biedt het Erasmus MC toegang tot de nieuwste apparatuur en technieken in een state-of-the-art omgeving.

Voor meer informatie over deze functie kunt u contact opnemen met dr. Hannes Lans, e-mail: w.lans@erasmusmc.nl. Voor meer informatie kunt u ook terecht op www.lanslab.eu