Wetenschappelijk medewerker metagenomics

Als onderdeel van het EU H2020-project VEO (Versatile Emerging Infective Disease Observatory) zijn we op zoek naar een post-doctoraal onderzoeker voor metagenoom analyses van rioolwater. Tijdens de COVID19 pandemie zijn consequent rioolwatermonsters verzameld in verschillende Europose steden om het coronavirus onafhankelijk van het testen van mensen te kunnen volgen. De maatregelen die genomen zijn om de pandemie te controleren hebben ook effect gehad op het voorkomen van andere infectieziekten. We gebruiken een tijdsreeks van een jaar rioolwatermonsters om het voorkomen van een breed scala aan (enterale) infecties te onderzoeken met behulp van metagenomcis. Uiteindelijk willen we de dynamiek van deze ziekteverwekkers relateren aan het verloop van de COVID19 pandemie en de maatregelen.

• Analyseren van metagenome datasets tot biologisch en epidemiologische relevante uitkomsten.
• Inhoudelijk en methodologisch afstemmen met collega's en internationale partners.
• Rapporteren van resultaten in rapporten, publicaties en symposia.
• Zorg dragen dat ontwikkelde sripts duurzaam worden achtergelaten.

• PhD met sterke aantoonbare ervaring in het werken met grote (meta)genoom datasets
• Aantoonbaar sterke bioinformatica skills
• Interesse en affiniteit met microbiologie, infectieziekten en/of volksgezondheid in het algemeen.
• Je kunt werken in een multidisciplinair team en in een internationale setting.
• Sterke schriftelijke en gesproken communicatieve vaardigheden in het Engels.

• Salarisniveau: schaal 11
• Maandsalaris: Min €3.608 – Max. €5.503 (bruto)
• Dienstverband: Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd
• Contractduur: Voor de duur van 12 maanden
• Minimaal aantal uren per week: 32
• Maximaal aantal uren per week: 36

Naast het salaris ontvang je een Individueel Keuzebudget (IKB). Het IKB bestaat uit geld (16,37% van je bruto jaarsalaris) en tijd. Met het IKB maak jij de keuzes die bij jou passen en kun je een deel van je arbeidsvoorwaarden zelf samenstellen. Je kunt er bijvoorbeeld voor kiezen om een deel van je maandinkomen te laten uitbetalen wanneer jij dat wenst. Ook kun je dit budget omzetten in verlof en andersom of besteden aan fiscaal vriendelijke doelen. De Rijksoverheid hecht sterk aan persoonlijke groei en loopbaanontwikkeling en biedt daarvoor tal van mogelijkheden. Tot de secundaire arbeidsvoorwaarden behoren onder meer verschillende studiefaciliteiten, bedrijfsfitness, volledige vergoeding van je OV-reiskosten woon-werkverkeer en gedeeltelijk betaald ouderschapsverlof.

Bij het RIVM werken ruim 2300 collega’s elke dag samen aan de zorg voor morgen. Het Centrum voor Infectieziektebestrijding (CIb) voert regie over de infectieziektebestrijding vanuit een nationale en internationale optiek. Dat betekent dat bij grote (landelijke) uitbraken de coördinatie van en communicatie over de bestrijding in handen is van het CIb. Dit in aansluiting op lokale en regionale infectieziektebestrijding.

Daarnaast formuleert het CIb het gewenste preventie- en bestrijdingsbeleid en geeft advies aan de overheid en de professionals in de praktijk. Het verricht hiertoe zelf wetenschappelijk onderzoek. Ook draagt het CIb bij aan de expertiseontwikkeling, kwaliteit en uniformiteit van de infectieziektebestrijding. Het zorgt voor heldere en betrouwbare communicatie naar publiek en professionals en voor een effectieve internationale samenwerking.

Je komt te werken binnen twee afdelingen. Ten eerste de afdeling epidemiologie en surveillance van enterale, vector-overdraagbare en (overige) zoonotische infecties (EVZ). Ten tweede, de afdeling Bacteriele en Parasitaire Diagnostistiek (BPD). Bij de eerste afdeling vind je meer inbedding in de epidemiologie en bij de tweede meer wat betreft microbiologie en bioinformatica. Er is op verschillende vlakken een zeer sterke interactie tussen deze afdelingen.