Software Engineer Genetica

De sectie Genoomdiagnostiek van de afdeling Genetica in het Radboudumc ambieert om voorop te blijven lopen op het gebied van de genetische patiënten diagnostiek. Hierbij worden de laatste technieken binnen het vakgebied van de genetica ingezet. We werken met de nieuwste technologieën om DNA te onderzoeken: van moderne methoden om DNA uit te lezen tot slimme algoritmes voor het opsporen van genetische varianten en software die helpt bij de interpretatie daarvan. Als software engineer speel jij hierin een belangrijke rol.

Onze processen zijn sterk geautomatiseerd; zowel in het natte lab (aansturing pipeteer robots) alsook in het analyseren van grote hoeveelheden data (Bioinformatica) en de interpretatie van de resultaten. Dagelijks verwerken wij rond de 150 DNA-samples met behulp van meerdere moderne onderzoeksmethoden.

Dit geautomatiseerde proces genereert grote hoeveelheden data (tot ~1TB per DNA-sample). De systemen verwerken informatie uit meerdere bronnen, sturen laboratoriumapparatuur aan en moeten zeer stabiel en efficiënt draaien. We gebruiken daarbij een mix van standaardsoftware, specifiek geconfigureerde pakketten en zelfontwikkelde toepassingen. De infrastructuur moet daarom flexibel, schaalbaar én betrouwbaar zijn, passend bij de hoge eisen van patiëntenzorg.

Onze ontwikkelstack omvat Java, Spring en Vaadin en onze tooling Atlassian, Github en Slack. Dit alles draait op een groot HPC (6PB met 1448 cores).

Wat ga je doen?
Als softwareontwikkelaar ben jij verantwoordelijk voor de software-infrastructuur die automatische aansturing, dataverwerking en data-interpretatie ondersteunt. Je schrijft niet alleen code, maar bent ook het technisch aanspreekpunt voor collega’s die met jouw oplossingen werken.

Dit doe je zelfstandig of in teamverband voor het gehele ontwikkelproces:

• Het opstellen van requirements & het maken van het ontwerp.
• Ontwikkeling in afstemming met eindgebruikers.
• Het testen en in productie brengen van nieuwe functionaliteit.

Zo bouw je mee aan nieuwe functionaliteiten die bijdragen aan betere diagnoses voor patiënten. Denk hierbij aan:

• Databases en systeemkoppelingen
• Grafische gebruikersinterfaces
• Geautomatiseerde workflows
• Backend-applicaties voor laboratorium-, genetische of algoritmische toepassingen

Bekijk dit nieuwsbericht over nieuwe manieren om het DNA uit te lezen om een beeld te krijgen waar wij onder meer aan werken.

Wat maakt je werk bijzonder?
Je werkt in een omgeving waar laboratoriumprocessen, patiëntenzorg, complexe algoritmen en enorme hoeveelheden data samenkomen. Dat vraagt niet alleen technische kennis, maar ook inzicht in de onderliggende processen en de architectuur waarin je oplossingen bouwt.

Klinkt dit als een uitdaging waar jij energie van krijgt? We maken graag kennis met je!

We zoeken een ervaren software engineer die niet alleen technisch sterk is, maar ook nieuwsgierig genoeg om zich snel onder te dompelen in een nieuw domein. Iemand die het leuk vindt om mee te denken over onze diagnostische processen en de brug kan slaan tussen laboratoriumwerk en technische oplossingen. Met jouw inzicht help je ons om complexe vraagstukken in de genetische diagnostiek om te zetten in stabiele, slimme en betrouwbare software.

Dit breng jij mee

• Een afgeronde opleiding Informatica (minimaal hbo) of vergelijkbaar.
• Meerdere jaren ervaring in een soortgelijke functie waarin je complexe systemen/software hebt ontwikkeld of beheerd.

Je bent goed bekend met

• Java 11+
• Objectgeoriënteerd programmeren & software design
• Git / Maven / Gradle
• Agile- en TDD-ontwikkelmethoden
• Spring Framework
• Docker
• Linux / HPC
• Integratiemethoden zoals SOAP / REST / JMS
• Relationele én document-databases

En je past goed bij onze werkomgeving als je

• Zelfstandig werkt en zowel de uitvoering als de voortgang helder bewaakt.
• Een eigen visie hebt, die je duidelijk kunt overbrengen, maar waarin je ook flexibel blijft bij input uit het team.
• Sociaal en communicatief vaardig bent — binnen je team én richting eindgebruikers.

Onze academische en vrije werkomgeving geeft je veel ruimte: je bent verantwoordelijk voor het gehele project. Daarvoor zoeken we iemand die eigenaarschap toont, initiatief neemt en energie krijgt van betekenisvol werk binnen de zorg.

Bij het Radboudumc bouw je aan de toekomst. We gaan voor de beste zorg, onderwijs en onderzoek. Dat maken we waar omdat je je bij ons ontwikkelt, kansen pakt en ruimte voelt om op te staan. Als werkgever vinden we het belangrijk dat medewerkers binnen alle levensfasen vitaal en met plezier aan het werk zijn. Dit in een gezonde en veilige omgeving. Onze arbeidsvoorwaarden mogen er ook zijn. Zo kun je rekenen op:

• Een bruto maandsalaris tussen € 3.598 en € 5.669 (schaal 10) bij een fulltime dienstverband (36 uur per week). Ook krijg je 8% vakantiegeld, 8,3% eindejaarsuitkering en, als dat voor je functie geldt, een onregelmatigheidstoelage van 47% tot 72%.
• 176 vakantie-uren per jaar op basis van een 36-urige werkweek.

De afdeling Genetica voert poliklinische behandelingen en diagnostiek van erfelijke ziekten uit en is daarmee één van de grootste genetica afdelingen in Europa. De onderzoeksgroepen verrichten baanbrekend onderzoek naar de relatie tussen genen en ziekten, in het bijzonder kanker, doofheid, blindheid, verstandelijke beperking en aangeboren afwijkingen.

Binnen deze afdeling is sectie Genoomdiagnostiek van een ISO 15189:2012 gecertificeerd laboratorium dat hoogwaardige genetische diagnostiek verzorgt voor patiënten en hun families. Dit wordt gedaan met ruim 170 medewerkers en voert jaarlijks meer dan 30,000 genetische testen uit voor meer dan 600 genetische aandoeningen met behulp van de laatste innovatieve genetische technieken.
Binnen onze sectie is LabICT (5 collega’s) verantwoordelijk voor alle niet‑standaard ICT‑ondersteuning. Je werkt aan koppelingen met externe systemen, maatwerk voor natlabprocessen, bioinformatica‑dataverwerking en applicaties voor interpretatie. Dit doe je in nauwe samenwerking met GeneticaICT (standaardapplicaties, beheer en advies) en Bioinformatica (dataverwerking en analyse).

Door de complexiteit van genetica, systeemontwikkeling en de diversiteit aan laboratoriumprocessen werken we in meerdere agile ontwikkelomgevingen rondom drie centrale ICT‑systemen. Samen zorgen we dat alle deelprocessen optimaal worden ondersteund.

Als software engineer combineer je techniek met praktijk: je ontwikkelt niet alleen oplossingen, maar integreert ze ook direct in de primaire laboratoriumprocessen binnen onze academische omgeving.

Benieuwd of deze functie bij je past? Of hoe het is om bij het Radboudumc te werken? Bel of mail dan met Steven Castelein, coördinerend bioinformaticus via (024) 36 68 940. Voor solliciteren gebruik de knop ‘solliciteer’.